公司注銷程序未盡，遺存留問題將引發以下后果：

一、企業層面的影響

1. 經營活動的束縛：盡管企業法人資格尚存，但其經營活動已受到嚴格限制。以未注銷吊銷狀態繼續營業的任何行為，都將被視為非法，企業可能面臨財產沒收、罰款，甚至承擔刑事責任的風險。

2. 信譽形象的摧毀：相關登記機關會將該企業列入經營異常名錄，并通過企業信用信息公示系統向社會公開，這一舉措將嚴重損害企業的市場信譽，對其在行業中的形象和交易機會造成重大打擊。

3. 資產處置的阻礙：對于企業的不動產如土地、房產等，其過戶等變更手續將無法辦理，這將對企業的資產處置帶來很大的不便。

4. 額外費用的累加：隨著時間的推移，行政管理部門可能對未注銷的吊銷企業進行強制注銷，這一過程中將產生額外的罰款、滯納金等費用，進一步增加企業的經濟負擔。

二、法定代表人層面的挑戰

1. 信用體系的受損：法定代表人的個人信用將受到損害，可能被列入失信名單，影響其在金融機構的信貸申請、信用卡辦理等業務。

2. 經營權限的受限：在一定的期限內，法定代表人將不得擔任其他企業的法定代表人、董事、監事、高級管理人員等職務，這對其職業生涯將造成一定的阻礙。

3. 出行方式的制約：乘坐飛機、高鐵等交通工具可能會受到限制，為法定代表人的日常生活帶來不便。

4. 法律責任的加重：若公司因違法行為被吊銷，法定代表人可能需承擔相應的法律責任，如對公司債務承擔連帶責任等；若未依法履行清算義務，還將面臨罰款、拘留等處罰。

三、股東層面的考量

1. 出資義務的加速到期：公司被吊銷后，若存在未繳足的出資，股東需在未出資范圍內對公司債務承擔連帶清償責任，加速了其出資義務的到期。

2. 股權處置的約束：股權的轉讓等處置可能會受到一定的限制。在辦理股權變更等手續時，相關部門可能會要求股東提供債務清償證明等材料。

3. 法律風險的增加：股東可能會因公司被吊銷而面臨法律訴訟等風險，債權人可能會起訴股東要求其承擔公司債務，增加了股東的法律風險。

在公司營業執照被吊銷后不進行注銷手續的情況下，會帶來多重負面影響：

一、對公司本身的不利影響：

1. 停業狀態下的運營困擾：企業即便營業執照被吊銷，其主體資格www.jc2s.com仍然存在。然而，公司不能再進行新合同的簽訂、新業務的開展以及款項收取等經營活動。這導致公司陷入停滯狀態，無法繼續運營。

2. 資產處置的難關：由于公司處于非正常經營狀態，其資產處置將面臨重大挑戰。比如，當公司意圖出售重要資產如房產、設備時，可能會因為營業執照被吊銷而遭遇法律障礙，買家會因擔心潛在的法律風險而拒絕購買。

3. 信譽的嚴重受損：營業執照被吊銷本身就是一種行政處罰，這一記錄將對公司的信譽造成很大的負面影響。在涉及公司重組、并購或其他商業合作機會時，合作伙伴一旦發現公司有被吊銷的記錄，往往會對公司的信譽產生懷疑并拒絕合作。

二、對股東及法人代表的深遠影響：

1. 股東的責任加重：公司不進行注銷，股東可能需對公司債務承擔連帶責任。即使公司營業執照被吊銷，其法人資格仍然存在，但已無法正常經營和償債。若公司存在未清償的債務，債權人可能通過法律途徑要求股東以其個人財產來償還公司債務。

2. 法人代表的職業受阻：法人代表將面臨多方面的職業限制。例如，在一段時間內（通常為三年），他們不得擔任其他企業的法定代表人、董事、監事、高級管理人員等職務，這對其職業發展構成嚴重阻礙。此外，在辦理個人事務如貸款、出入境簽證等方面也會遇到麻煩。

三、稅務與財務方面的挑戰：

1. 稅務問題的持續存在：公司被吊銷后仍需進行稅務清算。若不進行注銷，稅務問題將持續存在，包括商丘代辦營業執照可能存在的欠稅和滯納金等情況。稅務機關將繼續監管公司的稅務情況，并隨著時間的推移，欠稅金額可能因滯納金的累積而不斷增加。

2. 財務審計的困難：對于股東或其他利益相關者而言，若公司不注銷，財務審計將難以徹根完成。由于公司處于非正常經營狀態，無法提供完整、準確的財務報表和財務信息，這將影響對公司的財務狀況進行準確評估。